7 июня 1990 года на Поместном соборе Русской Православной Церкви в Москве был избран новый Патриарх Московский и Всея Руси. Им стал митрополит Ленинградский и Новгородский Алексий (в миру – Алексей Михайлович Ридигер), принявший имя Алексия II. Интронизация новоизбранного Патриарха состоялась 10 июня 1990 года в столичном Богоявленском соборе. Алексий II стал пятнадцатым Предстоятелем Русской Православной Церкви с введения Патриаршества на Руси (1589).
Алексий II был сильным церковным иерархом рубежа 20-21 веков. Он возложил на себя тяжкую миссию возрождения и укрепления Русской Церкви. Все дела Святейшего Патриарха увенчивались успехом и приносили благодатные плоды. Именно благодаря его стараниям произошло объединение Русской Православной Церкви (РПЦ) и Русской Православной Церкви за рубежом (РПЦЗ), он посетил значительное число епархий и церквей, везде утверждая Святое Православие, стараясь подбодрить людей и укрепить их веру.
Патриарх был награжден орденом «За заслуги перед Отечеством» I степени, орденом Петра Великого, общественным орденом Минина и Пожарского «Возвеличим Россию» за большой личный вклад в укрепление Российского государства, возрождение духовной силы Отечества. В 2005 году Алексию II была вручена премия «Человек года».
В июне того же года Священный Синод РПЦ наградил его орденом Славы и Чести – в ознаменование 15-летия первосвятительских трудов «на благо Церкви и Отечества». Патриарх также был лауреатом международной премии «Голубь мира» за неустанную миротворческую деятельность в целях достижения мира и согласия между народами.
Скончался Алексий II 5 декабря 2008 в своей резиденции, расположенной рядом с ж/д платформой и поселком Переделкино. Причиной смерти Патриарха стала острая сердечная недостаточность. В церемонии прощания с патриархом приняло участие более 100 000 человек. Отпевание Патриарха Алексия прошло в Храме Христа Спасителя, а похороны — в Богоявленском кафедральном соборе Москвы.