Зарождение казначейской службы произошло еще во времена Древней Руси, когда появилась должность казначея – должностного лица княжеской или боярской администрации, хранителя княжеских ценностей, которые назывались казной.
При Петре I в 1710 году была создана Счетная или Казначейская контора, которая должна была следить за правильным поступлением налогов.
Казенные палаты в каждой российской губернии «для домостроительных дел и управления казенных доходов Императорского Величества» были созданы в эпоху царствования Екатерины II.
При Александре I Управление финансами было распределено между тремя ведомствами – Министерством финансов, Государственным казначейством и Государственным контролером. Впоследствии Государственное казначейство становится подразделением Министерства финансов России, а в 1821 году был создан Департамент Государственного казначейства в структуре Минфина.
Именно с 1821 года в Российской Империи окончательно сложился и был отлажен четкий механизм деятельности казначейств от центрального – Департамента Государственного казначейства – до местных - губернских и уездных казначейств.
С 1918 года казначейство было расформировано, и его функции получили новые финансовые органы (сначала организованная казначейская финансовая комиссия, впоследствии - Наркомат финансов и Народный банк РСФСР, а затем – Министерство финансов СССР и союзных республик, Госбанк СССР и его территориальные органы).
8 декабря 1992 года Президент России Борис Ельцин подписал указ № 1556 о создании Федерального казначейства.
Его главной задачей является организация, осуществление и контроль за исполнением федерального бюджета, управление доходами и расходами федерального бюджета, для чего открываются счета казначейства в банках, исходя из принципа единства кассы.
Казначейство включает 83 управления и 2254 отделения. В 2002 году большинство федеральных учреждений (кроме отдельных учреждений Министерства обороны) были переведены на обслуживание через органы федерального казначейства. С 2002 года в казначействе открыты счета по учету внебюджетных средств 33 тысяч федеральных учреждений.
С 1 января 2005 года казначейство было выделено из состава Министерства финансов с преобразованием в федеральную службу, находящуюся в его ведении.
Сейчас Управление Федерального казначейства демонстрирует все преимущества казначейской системы исполнения бюджета. Коллектив специалистов Управления успешно выполняет свои обязанности и делает все возможное, чтобы обеспечивать своевременное прохождение бюджетных средств, поступающих из федерального центра в регионы.