25 января 1721 года Петр подписал манифест об учреждении Духовной Коллегии, получившей вскоре новое наименование Святейшего правительствующего Синода. Все члены нового органа управления церковью заблаговременно принесли присягу, и 14 февраля произошло его торжественное открытие.
Первоначально, согласно Духовному регламенту, Синод состоял из 11-и членов: президента, 2-х вице-президентов, 4-х советников и 4 ассессоров; в его состав входили архиереи, настоятели монастырей и лица белого духовенства. Представителем императора в церковном органе был обер-прокурор.
По устройству канцелярии и делопроизводства Синод напоминал Сенат и коллегии, со всеми заведенными в этих учреждениях чинами и обычаями. Поэтому Синод стал вскоре послушным орудием в руках государя.
Патриаршество в России было восстановлено только в 1917 году при Временном правительстве.